Gerontomics

Sistem de predicție bazat pe integrare multi-omics pentru prioritizarea intervențiilor gerontologice

DESPRE PROIECT DESPRE PROIECT

Institutul de Biochimie Bucureşti, Academia Română, derulează, începând cu data de 02.09.2016, proiectul “Sistem de predictie bazat pe integrare multi-omics pentru prioritizarea interventiilor gerontologice”, co-finanţat prin Fondul European de Dezvoltare Regională, în baza contractului de finanţare semnat cu Ministerul Educaţiei Naţionale şi Cercetării Ştiinţifice.

Valoarea totală a proiectului este de 8.524.757,50 lei, din care asistenţa finaciară nerambursabilă este de 8.502.557,50 lei. Durata proiectului este de 48 de luni.

Obiectivul general strategic propus prin proiect, este în conformitate cu obiectivele şi priorităţile Programului Operaţional Competitivitate 2014-2020 – Axa Prioritară 1 – Cercetare, Dezvoltare Tehnologică şi Inovare (CDI) în sprijinul Competitivităţii Economice şi Dezvoltării Afacerilor – Acțiunea 1.1.4 Atragerea de personal cu competențe avansate din străinătate pentru consolidarea capacității de CD.

We are currently developing a dataset portal for the Gerontomics data. This will include the hosting of all the datasets potentially of interest (both raw and processed data), tools for their integration, analysis pipelines and the interface to our machine learning module. More news soon. Stay tuned! To access the portal in its current form, please click here (limited access for developers).

DESCRIEREA PROIECTULUI DESCRIEREA PROIECTULUI

Imbatranirea populatiei (i.e., cresterea duratei medii de viata) este una dintre problemele biomedicale majore atat nationale cat si internationale ale secolului. Aceasta crestere, datorata imbunatatirilor venite din domeniul sanatatii, aduce beneficii semnificative, dar nu ofera neaparat o imbatranire sanatoasa si o crestere a healthspan-ului. Prin integrarea modelelor multiple de imbatranire (furnizate de specii diferite si modele experimentale variate) care capteaza intr-un mod holistic profilele diferentiale dintre starile „normale” si „dezechilibrate” ale sistemului biologic, proiectul isi propune analiza cu o acuratete semnificativ imbunatatita a mecanismelor de imbatranire, comparativ cu modelele actuale. O astfel de abordare este promitatoare pentru a intelege multiple aspecte ale imbatranirii, inclusiv modalitati de a extinde healthspan-ul, si pentru a reduce zgomotul statistic intrinsec oricarui screening individual.

Tintind in principal organizatiile de cercetare, dar si companiile din domeniul farmaceutic cu componenta de cercetare in domeniul biologiei imbatranirii, ne asteptam ca produsul final al acestui proiect sa reduca costurile, sa impulsioneze cercetarea si sa canalizeze studiile experimentale in gerontologie, ajutand la eficientizarea companiilor din aceste domenii prin reducerea costurilor financiare si de timp pentru validari experimentale (in vitro sau pe modele animal).

Din punct de vedere tehnologic, metodele folosite in acest proiect (modele de integrare multi-model, analiza datelor de scara larga, metode de analiza a retelelor biologice, deep neural nets) sunt foarte moderne si reprezinta „state-of-the-art” in domeniu. Proiectul are o natura intensiv computationala si va rezulta in elaborarea de noi algoritmi, metrici statistice si aplicarea de metode de inteligenta artificiala si invatare automata pentru rezolvarea problemelor din biologie. Prin analiza sistemica a datelor de genomica, transcriptomica, epigenetica si studii GWAS de la om si organisme model proiectul are ca scop aplicativ perfectionarea intelegerii noastre despre biologia imbatranirii, avand ca rezultat final crearea unei platforme integrative de predictie multi-omica pentru prioritizarea interventiilor experimentale in gerontologie.

Per ansamblu, proiectul va aduce contributii directe in aprofundarea cunostiintelor fundamentale ale biologiei imbatranirii. In acest sens, atat reducerea costurilor din cercetarea imbatranirii cat si dobandirea de informatii biologice noi despre imbatranire sunt arii cu o relevanta crescuta pentru „Imbatranirea sanatoasa, stil de viata si sanatate publica”, una din ariile prioritare in sanatate. In particular, studiind procesul imbatranirii vom contribui la dezvoltarea terapiilor preventive care au ca tinta extinderea duratei de viata si mai ales de viata sanatoasa a oamenilor (healthspan - definita ca perioada de timp activa, sanatoasa si productiva din viata unei persoane). Ambele obiective au potentialul de a avea un impact urias pentru calitatea vietii in societate, in mod particular pentru segmentul de populatie varstnica.